La meilleure période pour visiter le désert d’Agafay est au printemps (mars à mai) et en automne (septembre à novembre).
En été (juin à août), le climat peut être très chaud, avec des températures dépassant souvent 40°C, rendant les activités en journée plus éprouvantes, bien que certains camps proposent des espaces ombragés, des transats et des piscines pour se rafraîchir.
L’hiver (décembre à février) est plus frais, avec des températures pouvant descendre sous 10°C la nuit, mais l’expérience reste agréable, surtout pour ceux qui recherchent un dépaysement sans la chaleur accablante.
Pour une expérience optimale, il est conseillé de réserver en mi-saison et de privilégier les levers et couchers de soleil, moments où la vue sur le désert est la plus spectaculaire.